MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16G

Total Repeats: 951

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021527	CAA	2	6	106	111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846464
2	NC_021527	GTG	2	6	130	135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513846464
3	NC_021527	GGT	2	6	164	169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513846464
4	NC_021527	AAAT	2	8	218	225	75 %	25 %	0 %	0 %	513846464
5	NC_021527	ATC	2	6	230	235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846464
6	NC_021527	T	6	6	252	257	0 %	100 %	0 %	0 %	513846464
7	NC_021527	GTG	2	6	292	297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513846464
8	NC_021527	ACG	2	6	325	330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021527	CGAC	2	8	339	346	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021527	GTCAA	2	10	471	480	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_021527	AAAG	2	8	486	493	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021527	TGG	2	6	495	500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021527	TTG	2	6	503	508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513846465
14	NC_021527	AAG	2	6	554	559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846465
15	NC_021527	AG	3	6	612	617	50 %	0 %	50 %	0 %	513846465
16	NC_021527	CAGTT	2	10	753	762	20 %	40 %	20 %	20 %	513846465
17	NC_021527	GATTT	2	10	816	825	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021527	TAG	2	6	885	890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846466
19	NC_021527	TC	3	6	896	901	0 %	50 %	0 %	50 %	513846466
20	NC_021527	TAT	2	6	1066	1071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846466
21	NC_021527	CTG	2	6	1103	1108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513846466
22	NC_021527	CTC	2	6	1115	1120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	513846466
23	NC_021527	A	7	7	1134	1140	100 %	0 %	0 %	0 %	513846466
24	NC_021527	TCA	2	6	1189	1194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846466
25	NC_021527	CTG	2	6	1228	1233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513846467
26	NC_021527	TGG	2	6	1250	1255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513846467
27	NC_021527	TGG	2	6	1418	1423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513846467
28	NC_021527	AAC	2	6	1434	1439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846467
29	NC_021527	ATT	2	6	1479	1484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846467
30	NC_021527	GAT	3	9	1613	1621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846467
31	NC_021527	TTC	2	6	1758	1763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846468
32	NC_021527	GAC	2	6	1772	1777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846468
33	NC_021527	CAC	2	6	1784	1789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513846468
34	NC_021527	TTCC	2	8	1800	1807	0 %	50 %	0 %	50 %	513846468
35	NC_021527	AGC	2	6	1881	1886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846468
36	NC_021527	GC	3	6	1885	1890	0 %	0 %	50 %	50 %	513846468
37	NC_021527	TGA	2	6	1920	1925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846468
38	NC_021527	CTTG	2	8	2036	2043	0 %	50 %	25 %	25 %	513846468
39	NC_021527	TAA	2	6	2051	2056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846468
40	NC_021527	TAG	2	6	2068	2073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846468
41	NC_021527	CAG	2	6	2105	2110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846468
42	NC_021527	GCC	2	6	2118	2123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513846468
43	NC_021527	CTT	2	6	2168	2173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846468
44	NC_021527	CTT	2	6	2253	2258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846468
45	NC_021527	TCT	2	6	2278	2283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846468
46	NC_021527	GTT	2	6	2304	2309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513846468
47	NC_021527	ATG	2	6	2344	2349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846468
48	NC_021527	ACC	2	6	2403	2408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513846468
49	NC_021527	GCA	2	6	2440	2445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846468
50	NC_021527	TGA	2	6	2489	2494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846468
51	NC_021527	CTT	2	6	2502	2507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846468
52	NC_021527	CAA	2	6	2528	2533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846468
53	NC_021527	ATA	2	6	2551	2556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846468
54	NC_021527	AAC	2	6	2559	2564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846468
55	NC_021527	CAA	2	6	2588	2593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846468
56	NC_021527	GAA	2	6	2694	2699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846468
57	NC_021527	GCT	2	6	2741	2746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513846468
58	NC_021527	GAA	2	6	2783	2788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846468
59	NC_021527	AGT	2	6	2831	2836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846468
60	NC_021527	GGT	2	6	2856	2861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513846468
61	NC_021527	TTC	2	6	2980	2985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846468
62	NC_021527	CTT	2	6	3020	3025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846468
63	NC_021527	TCT	2	6	3062	3067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846468
64	NC_021527	ATA	2	6	3175	3180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846468
65	NC_021527	TC	3	6	3183	3188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_021527	AATTT	2	10	3247	3256	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021527	TTAAA	2	10	3269	3278	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021527	ATT	2	6	3287	3292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846469
69	NC_021527	ATC	2	6	3309	3314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846469
70	NC_021527	TTGA	2	8	3366	3373	25 %	50 %	25 %	0 %	513846469
71	NC_021527	ATC	2	6	3375	3380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846469
72	NC_021527	TTGAA	2	10	3591	3600	40 %	40 %	20 %	0 %	513846469
73	NC_021527	TGAC	2	8	3608	3615	25 %	25 %	25 %	25 %	513846469
74	NC_021527	GCT	2	6	3725	3730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513846469
75	NC_021527	GCCA	2	8	3795	3802	25 %	0 %	25 %	50 %	513846469
76	NC_021527	AGC	2	6	3807	3812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846469
77	NC_021527	TTG	2	6	3845	3850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513846469
78	NC_021527	AAC	2	6	3972	3977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846469
79	NC_021527	GTT	3	9	3979	3987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513846469
80	NC_021527	ATG	2	6	3992	3997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846469
81	NC_021527	TGC	2	6	4080	4085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513846469
82	NC_021527	AAC	2	6	4155	4160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846469
83	NC_021527	CAA	2	6	4205	4210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846469
84	NC_021527	AAT	2	6	4233	4238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846469
85	NC_021527	GACA	2	8	4286	4293	50 %	0 %	25 %	25 %	513846469
86	NC_021527	GTC	2	6	4320	4325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513846469
87	NC_021527	CGT	2	6	4349	4354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513846469
88	NC_021527	AAC	2	6	4386	4391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846469
89	NC_021527	TGC	2	6	4392	4397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513846469
90	NC_021527	AT	3	6	4427	4432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021527	AGC	2	6	4446	4451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021527	TCAT	2	8	4542	4549	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_021527	CTCG	2	8	4553	4560	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_021527	ACC	2	6	4589	4594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_021527	AAT	2	6	4646	4651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021527	ATT	2	6	4692	4697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021527	GAA	2	6	4712	4717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021527	ATT	2	6	4718	4723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021527	AAAG	2	8	4816	4823	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021527	CAA	2	6	4997	5002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846470
101	NC_021527	ACA	2	6	5020	5025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846470
102	NC_021527	TGA	2	6	5056	5061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846470
103	NC_021527	ATT	2	6	5111	5116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846470
104	NC_021527	GCG	2	6	5142	5147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513846470
105	NC_021527	CATG	2	8	5209	5216	25 %	25 %	25 %	25 %	513846470
106	NC_021527	ACG	2	6	5245	5250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846470
107	NC_021527	TCA	2	6	5432	5437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846470
108	NC_021527	AGC	2	6	5458	5463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513846470
109	NC_021527	GCCAC	2	10	5479	5488	20 %	0 %	20 %	60 %	513846470
110	NC_021527	TGAA	2	8	5607	5614	50 %	25 %	25 %	0 %	513846470
111	NC_021527	CAA	2	6	5620	5625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846470
112	NC_021527	TCA	2	6	5658	5663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846470
113	NC_021527	AAATC	2	10	5764	5773	60 %	20 %	0 %	20 %	513846470
114	NC_021527	TGA	2	6	5776	5781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846470
115	NC_021527	GAA	2	6	5814	5819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021527	TAA	2	6	5820	5825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021527	GCT	2	6	5831	5836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021527	ATT	2	6	5870	5875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021527	CTA	2	6	5916	5921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021527	AT	3	6	6127	6132	50 %	50 %	0 %	0 %	513846471
121	NC_021527	AT	3	6	6146	6151	50 %	50 %	0 %	0 %	513846471
122	NC_021527	TCA	2	6	6239	6244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846471
123	NC_021527	T	6	6	6249	6254	0 %	100 %	0 %	0 %	513846471
124	NC_021527	T	6	6	6283	6288	0 %	100 %	0 %	0 %	513846471
125	NC_021527	CTT	2	6	6314	6319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513846472
126	NC_021527	TTCT	2	8	6409	6416	0 %	75 %	0 %	25 %	513846472
127	NC_021527	CTA	2	6	6456	6461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846472
128	NC_021527	ATT	2	6	6525	6530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846472
129	NC_021527	AT	3	6	6538	6543	50 %	50 %	0 %	0 %	513846472
130	NC_021527	T	7	7	6568	6574	0 %	100 %	0 %	0 %	513846472
131	NC_021527	GTT	2	6	6583	6588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513846472
132	NC_021527	AAG	2	6	6608	6613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846472
133	NC_021527	TCA	2	6	6648	6653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846472
134	NC_021527	TCA	2	6	6984	6989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846472
135	NC_021527	GTT	2	6	7017	7022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513846472
136	NC_021527	AAT	2	6	7098	7103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846472
137	NC_021527	TTGT	2	8	7131	7138	0 %	75 %	25 %	0 %	513846472
138	NC_021527	ACC	2	6	7151	7156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513846472
139	NC_021527	CTC	2	6	7198	7203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_021527	CAG	2	6	7236	7241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_021527	AT	3	6	7249	7254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021527	ACAA	2	8	7388	7395	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_021527	A	9	9	7438	7446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021527	AAT	2	6	7469	7474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021527	GCTA	2	8	7540	7547	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_021527	ACT	2	6	7556	7561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_021527	AGT	2	6	7565	7570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021527	CATA	2	8	7645	7652	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_021527	GGC	2	6	7686	7691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_021527	TTTG	2	8	7703	7710	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021527	TAAA	2	8	7778	7785	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021527	A	6	6	7787	7792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021527	TGA	2	6	7883	7888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_021527	ATG	2	6	7998	8003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_021527	T	6	6	8025	8030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_021527	CAA	2	6	8069	8074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513846473
157	NC_021527	GATT	2	8	8077	8084	25 %	50 %	25 %	0 %	513846473
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160	NC_021527	AAG	2	6	8250	8255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513846473
161	NC_021527	GTTGAC	2	12	8390	8401	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	513846473
162	NC_021527	TAT	2	6	8516	8521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513846473
163	NC_021527	TGA	2	6	8527	8532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846473
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165	NC_021527	GTGC	2	8	8576	8583	0 %	25 %	50 %	25 %	513846473
166	NC_021527	TAC	2	6	8615	8620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513846473
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169	NC_021527	TTAA	2	8	8855	8862	50 %	50 %	0 %	0 %	513846473
170	NC_021527	TAAT	2	8	9030	9037	50 %	50 %	0 %	0 %	513846473
171	NC_021527	AAT	2	6	9254	9259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513846473
172	NC_021527	GCAA	2	8	9385	9392	50 %	0 %	25 %	25 %	513846473
173	NC_021527	GTA	2	6	9408	9413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846473
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178	NC_021527	TGA	2	6	9529	9534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846473
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180	NC_021527	GTT	2	6	9692	9697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
181	NC_021527	TTA	2	6	9701	9706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_021527	GTC	2	6	9707	9712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_021527	CTC	2	6	9741	9746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
184	NC_021527	AGT	2	6	9835	9840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
185	NC_021527	TGA	2	6	9853	9858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
186	NC_021527	AGT	2	6	9861	9866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
187	NC_021527	T	6	6	9914	9919	0 %	100 %	0 %	0 %	513846474
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219	NC_021527	TGA	2	6	12520	12525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513846474
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267	NC_021527	CGG	2	6	15067	15072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513846477
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